秋季管理日照漸短，開放式藍孔雀舍要點燈補充光照。母藍孔雀每天保持14小時，后逐漸增至16小時。做好秋季預防接種與驅蟲工作在霜降前后，做好安全越冬的一切準備工作。
秋季是換羽季節，為了加速換羽，飼料中蛋白質水平可降至18%-19%，但要保證含硫氨基酸的供應。經難證明，在飼料中加入1%的生石膏粉，有助于新羽再生。換羽期的種藍孔雀一般每天飼喂三次山東孔雀。秋季換羽期間可增喂火麻仁等，有利換羽。秋季換羽期間采取強制性換羽措施，可以有效地縮短自然換羽天數。在不限制飼喂的條件下，酌喂氧化鋅添加劑，可使孔雀七-十天后加速換羽，夜間可試拔主翼羽、覆尾羽，如能輕易拔除則拔羽，拔不動則不要拔，50%羽毛脫落或拔除時，則應停喂鋅添加劑。也可使用肌注2500-5000國際單位睪丸酮和5-10毫克的甲狀腺素，被肌注母孔雀變得遲頓和不愛活動個別還出現“企鵝”姿勢。經三至四天后癥狀消失，一般于注射后第二天停產，至五至七天幾乎全部脫落落大方并開始迅速長出新羽束山東孔雀。此方法同樣要做一些活體試驗后應用，另外在飼糧中要增加支票物蛋白質和維生素、礦物質、微量元素的含量促進羽毛生長。及時淘汰掉病、弱不禁風藍孔雀，以及繁殖性能下降或超階級過種用年限的藍孔雀大部分已停產換羽時，可對藍孔雀進行徹底消毒、接種疫苗和驅蟲。